Ang Endosymbiosis ay isang unyon sa pagitan ng mga species, kung saan ang isa sa kanila ay nakatira sa loob ng isa pa. Ang ilang mga organelles ng eukaryotic cells, tulad ng mga chloroplast at mitochondria, na nagmula sa kanilang orihinal na simbiosis na may ilang bakterya. Sa proseso ng endosymbiosis, ang elementong simbiotiko ay naninirahan sa intracellular space ng host. Ang isang halimbawa ng mga ispesimen na ito ay: zooxanthellae, na isang uri ng algae na naninirahan sa mga cell ng ilang mga coral.
Ang teoryang endosymbiotic ay nagsasaad na ang isang eukaryotic cell ay may kakayahang ilakip ang sarili sa isa pa, upang mapanatili ang isang pamumuhay kung saan kapwa nakikinabang, yamang ang host ay masisiyahan sa prutas na inilabas ng endosymbiont. Sa kabilang banda, pinatutunayan din ng teoryang ito na ang mga unang organelles na nagbabago ay ang mitochondria at pagkatapos, sa pamamagitan ng serial endosymbiosis, ang ninuno eukaryotic corpuscle ay nakakakuha ng isang endosymbiont na may kakayahang isagawa ang photosynthesis, na kung saan ay magkakaroon ng mga eukaryotic cell organelles na darating upang makabuo ng ano ang unang berdeng algae.
Mayroong ilang katibayan na nagsasaad na ang mitochondria at mga plastid ay ipinanganak mula sa proseso ng endosymbiosis, ang isa sa mga ito ay ang laki ng mitochondria, na kapareho ng ilang bakterya. Parehong mga chloroplast at mitochondria ay binubuo ng covalently closed circular double-straced DNA. Natatakpan sila ng isang dobleng tela. Ang mga chloroplast at mitochondria ay nahahati sa binary fission, tulad ng mga prokaryote. Ang synthesis ng protina, kapwa sa mitochondria at chloroplasts, ay malaya.